37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1746 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1746  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  203  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3720  hypothetical protein  85.05 
 
 		 107 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1583  hypothetical protein  82.08 
 
 		 107 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4348  protein of unknown function DUF1476  86.79 
 
 		 107 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1632  hypothetical protein  74.29 
 
 		 131 aa  157  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1303  hypothetical protein  72.38 
 
 		 108 aa  153  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5410  hypothetical protein  72.64 
 
 		 106 aa  144  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0948741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4094  hypothetical protein  65.09 
 
 		 106 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2590  hypothetical protein  65.71 
 
 		 105 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254891  normal  0.154135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3442  hypothetical protein  52.34 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1282  hypothetical protein  52.38 
 
 		 106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0843  hypothetical protein  59.05 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1075  protein of unknown function DUF1476  58.25 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2546  hypothetical protein  65.93 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43721  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1033  hypothetical protein  50.48 
 
 		 107 aa  103  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.118676 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0710  hypothetical protein  57.58 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2521  hypothetical protein  56.52 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453827  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0355  hypothetical protein  51.52 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2381  hypothetical protein  54.29 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0800  hypothetical protein  52.29 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2125  hypothetical protein  52.29 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1466  hypothetical protein  56.12 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0835  HpcH/HpaI aldolase  60.92 
 
 		 304 aa  94.7  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4710  hypothetical protein  44.86 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2862  hypothetical protein  55.56 
 
 		 104 aa  90.5  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0900552  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1497  hypothetical protein  50.96 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.107399 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3123  hypothetical protein  48 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1178  protein of unknown function DUF1476  42.31 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0714  hypothetical protein  40.82 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2605  hypothetical protein  33.94 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0251108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0416  hypothetical protein  34.74 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.883077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2870  hypothetical protein  31.43 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7066  protein of unknown function DUF1476  31.03 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.769314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6239  hypothetical protein  31.03 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.613467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2394  hypothetical protein  34.02 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3594  hypothetical protein  42.11 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581607  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1707  hypothetical protein  28.95 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>