25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2394 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2394  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  241  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0572  hypothetical protein  56 
 
 		 118 aa  100  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.172357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1239  hypothetical protein  57.14 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0416  hypothetical protein  40.59 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.883077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1128  hypothetical protein  53.42 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.408689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2605  hypothetical protein  38.78 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0251108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2521  hypothetical protein  36.67 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6239  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.613467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2870  hypothetical protein  36.52 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0714  hypothetical protein  33 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1033  hypothetical protein  30.11 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.118676 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0355  hypothetical protein  34.44 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5410  hypothetical protein  34.44 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0948741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1303  hypothetical protein  30.85 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1282  hypothetical protein  37.97 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3720  hypothetical protein  30.69 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7066  protein of unknown function DUF1476  35.48 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.769314  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4094  hypothetical protein  32.35 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1632  hypothetical protein  30.85 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1746  hypothetical protein  34.02 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1583  hypothetical protein  34 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3442  hypothetical protein  32.22 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4710  hypothetical protein  28.28 
 
 		 107 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3594  hypothetical protein  38.38 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581607  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2590  hypothetical protein  30.53 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254891  normal  0.154135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>