35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2862 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2862  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  206  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0900552  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1075  protein of unknown function DUF1476  66.02 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0710  hypothetical protein  62.14 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2125  hypothetical protein  58.25 
 
 		 106 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0800  hypothetical protein  58.25 
 
 		 106 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2546  hypothetical protein  58.65 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43721  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1466  hypothetical protein  61 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5410  hypothetical protein  62.14 
 
 		 106 aa  113  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0948741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2590  hypothetical protein  58.25 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254891  normal  0.154135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3442  hypothetical protein  58.25 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1282  hypothetical protein  54.72 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1033  hypothetical protein  51.89 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.118676 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0355  hypothetical protein  57.14 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4710  hypothetical protein  51.92 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2521  hypothetical protein  52.83 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453827  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1303  hypothetical protein  51.96 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2381  hypothetical protein  56.73 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1583  hypothetical protein  53.4 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_004310  BR0843  hypothetical protein  55.77 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4094  hypothetical protein  51.46 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1746  hypothetical protein  55.56 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3720  hypothetical protein  52.43 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1632  hypothetical protein  50.98 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0835  HpcH/HpaI aldolase  64.1 
 
 		 304 aa  85.9  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1178  protein of unknown function DUF1476  46.6 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4348  protein of unknown function DUF1476  52.43 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1497  hypothetical protein  52.43 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.107399 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3123  hypothetical protein  44.57 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0714  hypothetical protein  38.83 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7066  protein of unknown function DUF1476  38.27 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.769314  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0416  hypothetical protein  39.33 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.883077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2870  hypothetical protein  36.36 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6239  hypothetical protein  45.45 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.613467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2605  hypothetical protein  40.91 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0251108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3594  hypothetical protein  38.83 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581607  normal  0.055135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>