32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3160 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3160  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  263  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.0129313 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2108  gene transfer agent (GTA) like protein  61.07 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354227  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3466  gene transfer agent (GTA) orfg8  58.96 
 
 		 136 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.018674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1418  gene transfer agent (GTA) like protein  57.46 
 
 		 136 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1982  gene transfer agent (GTA) orfg8  57.81 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.504072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1173  gene transfer agent (GTA) like protein  57.46 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.777288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1815  gene transfer agent (GTA) orfg8  54.14 
 
 		 136 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00634922  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0910  gene transfer agent (GTA) orfg8  53.08 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_004310  BR0593  hypothetical protein  41.48 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0594  hypothetical protein  42.75 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0248  hypothetical protein  32.03 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3911  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.27509  normal  0.122055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1422  hypothetical protein  36.21 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1700  hypothetical protein  37.61 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.1304  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1426  hypothetical protein  37.61 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0396339  normal  0.212988 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1638  hypothetical protein  33.07 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1081  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.085931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1064  hypothetical protein  39.53 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0784878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3937  hypothetical protein  29.32 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1887  hypothetical protein  29.13 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.526852  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1757  hypothetical protein  30.08 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1325  gene transfer agent  34.78 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00376041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1343  hypothetical protein  39.13 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0110782  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2171  hypothetical protein  30.16 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0351  hypothetical protein  24.17 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0360  hypothetical protein  24.17 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0996  gene transfer agent  31.11 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.95396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5448  hypothetical protein  35.11 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1978  hypothetical protein  30.95 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2606  gene transfer agent  39.18 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0897479  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4289  gene transfer agent  39.18 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967764  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3985  hypothetical protein  31.16 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>