17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1700 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1700  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  264  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.1304  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1426  hypothetical protein  96.35 
 
 		 139 aa  225  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0396339  normal  0.212988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1422  hypothetical protein  87.5 
 
 		 139 aa  204  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4971  hypothetical protein  60.74 
 
 		 142 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.641384  hitchhiker  0.0000964141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1173  gene transfer agent (GTA) like protein  41.86 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.777288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1815  gene transfer agent (GTA) orfg8  39.23 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00634922  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3466  gene transfer agent (GTA) orfg8  39.53 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.018674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1418  gene transfer agent (GTA) like protein  40.31 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1982  gene transfer agent (GTA) orfg8  38.93 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.504072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2108  gene transfer agent (GTA) like protein  39.23 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0594  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0593  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0910  gene transfer agent (GTA) orfg8  37.69 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1978  hypothetical protein  30.47 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579415  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0996  gene transfer agent  26.15 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.95396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1757  hypothetical protein  30.6 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1325  gene transfer agent  30.94 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00376041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>