24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0996 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0996  gene transfer agent  100 
 
 		 135 aa  272  9e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.95396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4289  gene transfer agent  36.09 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967764  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1978  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2606  gene transfer agent  37.31 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0897479  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0248  hypothetical protein  32.33 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1325  gene transfer agent  32.58 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00376041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1757  hypothetical protein  29.1 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1367  hypothetical protein  32.84 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2108  gene transfer agent (GTA) like protein  33.08 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0284  hypothetical protein  30.6 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3466  gene transfer agent (GTA) orfg8  30.6 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.018674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0593  hypothetical protein  39.47 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0594  hypothetical protein  40.54 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1887  hypothetical protein  30.08 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.526852  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1982  gene transfer agent (GTA) orfg8  31.85 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.504072 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0367  hypothetical protein  36.36 
 
 		 98 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1418  gene transfer agent (GTA) like protein  32.84 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0868  hypothetical protein  31.88 
 
 		 305 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0683632  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1173  gene transfer agent (GTA) like protein  32.09 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.777288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0910  gene transfer agent (GTA) orfg8  29.32 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1815  gene transfer agent (GTA) orfg8  27.94 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00634922  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5448  hypothetical protein  32.58 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1620  hypothetical protein  30.37 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.616649  normal  0.259458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1476  hypothetical protein  30.37 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>