23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1887 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1887  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.526852  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0284  hypothetical protein  41.61 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5448  hypothetical protein  45.04 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3985  hypothetical protein  41.48 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0868  hypothetical protein  40.32 
 
 		 305 aa  90.9  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0683632  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1367  hypothetical protein  40.44 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1620  hypothetical protein  38.35 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.616649  normal  0.259458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1476  hypothetical protein  37.59 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1978  hypothetical protein  33.59 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579415  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2483  hypothetical protein  32.86 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2108  gene transfer agent (GTA) like protein  31.25 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354227  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1815  gene transfer agent (GTA) orfg8  33.6 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00634922  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6047  hypothetical protein  32.09 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1757  hypothetical protein  31.11 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0996  gene transfer agent  30.08 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.95396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3466  gene transfer agent (GTA) orfg8  28.46 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.018674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1982  gene transfer agent (GTA) orfg8  30.95 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.504072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1418  gene transfer agent (GTA) like protein  30.95 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1325  gene transfer agent  26.67 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00376041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1173  gene transfer agent (GTA) like protein  27.78 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.777288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0248  hypothetical protein  28.12 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0594  hypothetical protein  27.42 
 
 		 135 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0593  hypothetical protein  27.42 
 
 		 135 aa  40  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>