31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1418 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1418  gene transfer agent (GTA) like protein  100 
 
 		 136 aa  269  8.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1173  gene transfer agent (GTA) like protein  89.71 
 
 		 136 aa  245  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.777288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3466  gene transfer agent (GTA) orfg8  75.74 
 
 		 136 aa  207  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.018674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1982  gene transfer agent (GTA) orfg8  76.12 
 
 		 136 aa  204  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.504072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2108  gene transfer agent (GTA) like protein  71.32 
 
 		 136 aa  200  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354227  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1815  gene transfer agent (GTA) orfg8  72.59 
 
 		 136 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00634922  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3160  hypothetical protein  58.33 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.0129313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0910  gene transfer agent (GTA) orfg8  45.8 
 
 		 133 aa  93.6  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_004310  BR0593  hypothetical protein  37.04 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0594  hypothetical protein  37.04 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1700  hypothetical protein  38.46 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.1304  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1426  hypothetical protein  38.46 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0396339  normal  0.212988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1422  hypothetical protein  38.46 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1325  gene transfer agent  36.64 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00376041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3911  hypothetical protein  37.98 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.27509  normal  0.122055 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1978  hypothetical protein  34.92 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579415  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1638  hypothetical protein  35.82 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3937  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0248  hypothetical protein  29.63 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1343  hypothetical protein  35.87 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0110782  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1757  hypothetical protein  29.55 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0996  gene transfer agent  32.84 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.95396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2171  hypothetical protein  31.25 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1887  hypothetical protein  30.95 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.526852  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1081  hypothetical protein  36.54 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.085931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1064  hypothetical protein  38.26 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0784878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4971  hypothetical protein  36.28 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.641384  hitchhiker  0.0000964141 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6054  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1136  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0360  hypothetical protein  26.51 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0351  hypothetical protein  26.51 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>