15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3911 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3911  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  262  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.27509  normal  0.122055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1815  gene transfer agent (GTA) orfg8  39.84 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00634922  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3466  gene transfer agent (GTA) orfg8  39.06 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.018674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1982  gene transfer agent (GTA) orfg8  38.94 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.504072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1418  gene transfer agent (GTA) like protein  37.98 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2108  gene transfer agent (GTA) like protein  36.22 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354227  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1173  gene transfer agent (GTA) like protein  35.88 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.777288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0910  gene transfer agent (GTA) orfg8  34.38 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0594  hypothetical protein  29.23 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0593  hypothetical protein  29.23 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3160  hypothetical protein  40.38 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.0129313 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0996  gene transfer agent  30.23 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.95396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1887  hypothetical protein  30.71 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.526852  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1978  hypothetical protein  35.29 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579415  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1757  hypothetical protein  30.08 
 
 		 135 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>