23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0593 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0593  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  278  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0594  hypothetical protein  99.26 
 
 		 135 aa  276  7e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1982  gene transfer agent (GTA) orfg8  42.65 
 
 		 136 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.504072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3466  gene transfer agent (GTA) orfg8  42.22 
 
 		 136 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.018674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1815  gene transfer agent (GTA) orfg8  42.34 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00634922  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2108  gene transfer agent (GTA) like protein  39.26 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3160  hypothetical protein  40.74 
 
 		 139 aa  86.7  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.0129313 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1418  gene transfer agent (GTA) like protein  37.04 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0910  gene transfer agent (GTA) orfg8  38.28 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1173  gene transfer agent (GTA) like protein  34.81 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.777288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0996  gene transfer agent  39.47 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.95396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1426  hypothetical protein  29.66 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0396339  normal  0.212988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1700  hypothetical protein  29.66 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.1304  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0248  hypothetical protein  27.59 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1422  hypothetical protein  27.73 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3911  hypothetical protein  29.23 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.27509  normal  0.122055 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1978  hypothetical protein  27.07 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579415  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1757  hypothetical protein  28.95 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2606  gene transfer agent  29.01 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0897479  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4289  gene transfer agent  29.77 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967764  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1638  hypothetical protein  28.18 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1343  hypothetical protein  27.18 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0110782  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3937  hypothetical protein  25.37 
 
 		 128 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>