15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3937 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3937  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  258  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1815  gene transfer agent (GTA) orfg8  32.33 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00634922  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3466  gene transfer agent (GTA) orfg8  32.71 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.018674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1173  gene transfer agent (GTA) like protein  30.66 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.777288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1982  gene transfer agent (GTA) orfg8  33.98 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.504072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2108  gene transfer agent (GTA) like protein  30.66 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1418  gene transfer agent (GTA) like protein  31.58 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0910  gene transfer agent (GTA) orfg8  31.54 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0248  hypothetical protein  34.65 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1978  hypothetical protein  31.01 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579415  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0593  hypothetical protein  25.37 
 
 		 135 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0594  hypothetical protein  25.78 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0284  hypothetical protein  31.18 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1081  hypothetical protein  35.48 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.085931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2606  gene transfer agent  34.55 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0897479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>