18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1081 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1081  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  253  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.085931 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6054  hypothetical protein  70.45 
 
 		 132 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1136  hypothetical protein  68.94 
 
 		 132 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1638  hypothetical protein  49.25 
 
 		 136 aa  113  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1064  hypothetical protein  53.33 
 
 		 135 aa  113  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0784878 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2171  hypothetical protein  41.48 
 
 		 136 aa  98.2  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2895  hypothetical protein  47.45 
 
 		 139 aa  96.7  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1418  gene transfer agent (GTA) like protein  36.3 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1173  gene transfer agent (GTA) like protein  36.36 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.777288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0910  gene transfer agent (GTA) orfg8  37.12 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1815  gene transfer agent (GTA) orfg8  33.59 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00634922  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3466  gene transfer agent (GTA) orfg8  33.59 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.018674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3937  hypothetical protein  36.04 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1982  gene transfer agent (GTA) orfg8  31.73 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.504072 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1978  hypothetical protein  33.82 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579415  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1343  hypothetical protein  35.16 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0110782  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2108  gene transfer agent (GTA) like protein  29.81 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3160  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.0129313 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>