10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_6054 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_6054  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  256  8e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1136  hypothetical protein  97.73 
 
 		 132 aa  251  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1081  hypothetical protein  70.45 
 
 		 132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.085931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2171  hypothetical protein  48.89 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1064  hypothetical protein  52.59 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0784878 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1638  hypothetical protein  46.67 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2895  hypothetical protein  51.09 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1815  gene transfer agent (GTA) orfg8  33.59 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00634922  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0910  gene transfer agent (GTA) orfg8  37.98 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1418  gene transfer agent (GTA) like protein  33.33 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>