17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1638 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1638  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  268  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2171  hypothetical protein  43.28 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2895  hypothetical protein  52.52 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1064  hypothetical protein  50.38 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0784878 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1136  hypothetical protein  46.67 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6054  hypothetical protein  46.67 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1081  hypothetical protein  49.25 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.085931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1978  hypothetical protein  37.96 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579415  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1418  gene transfer agent (GTA) like protein  35.82 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1173  gene transfer agent (GTA) like protein  34.85 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.777288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3466  gene transfer agent (GTA) orfg8  34.33 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.018674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1815  gene transfer agent (GTA) orfg8  34.09 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00634922  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0910  gene transfer agent (GTA) orfg8  36.21 
 
 		 133 aa  50.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1982  gene transfer agent (GTA) orfg8  33.59 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.504072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2108  gene transfer agent (GTA) like protein  33.59 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0594  hypothetical protein  28.18 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0593  hypothetical protein  28.18 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>