15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1064 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1064  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  265  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0784878 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2171  hypothetical protein  51.85 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1638  hypothetical protein  50.38 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1136  hypothetical protein  53.33 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6054  hypothetical protein  52.59 
 
 		 132 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1081  hypothetical protein  53.33 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.085931 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2895  hypothetical protein  49.64 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1173  gene transfer agent (GTA) like protein  39.53 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.777288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3466  gene transfer agent (GTA) orfg8  36.64 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.018674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1418  gene transfer agent (GTA) like protein  38.26 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0910  gene transfer agent (GTA) orfg8  39.47 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1815  gene transfer agent (GTA) orfg8  36.36 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00634922  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1982  gene transfer agent (GTA) orfg8  34.78 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.504072 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1978  hypothetical protein  32.85 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579415  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2108  gene transfer agent (GTA) like protein  33.33 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>