11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1343 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1343  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  256  8e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0110782  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1982  gene transfer agent (GTA) orfg8  33.08 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.504072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1173  gene transfer agent (GTA) like protein  33.83 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.777288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3466  gene transfer agent (GTA) orfg8  34.59 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.018674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1418  gene transfer agent (GTA) like protein  33.83 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1815  gene transfer agent (GTA) orfg8  31.75 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00634922  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2108  gene transfer agent (GTA) like protein  29.37 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354227  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0593  hypothetical protein  26.19 
 
 		 135 aa  47.8  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0594  hypothetical protein  26.19 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1081  hypothetical protein  35.16 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.085931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3160  hypothetical protein  39.13 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.0129313 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>