12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4289 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4289  gene transfer agent  100 
 
 		 132 aa  259  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2606  gene transfer agent  99.24 
 
 		 132 aa  257  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0897479  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0996  gene transfer agent  36.09 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.95396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1325  gene transfer agent  37.4 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00376041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0248  hypothetical protein  41.57 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1978  hypothetical protein  36.22 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579415  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0910  gene transfer agent (GTA) orfg8  35.82 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_004310  BR0593  hypothetical protein  29.77 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0594  hypothetical protein  29.77 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3466  gene transfer agent (GTA) orfg8  40.4 
 
 		 136 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.018674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1757  hypothetical protein  32.63 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0382  hypothetical protein  25.64 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.743752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>