29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0868 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0868  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  621  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0683632  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1620  hypothetical protein  55.73 
 
 		 144 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.616649  normal  0.259458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1476  hypothetical protein  54.2 
 
 		 144 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0284  hypothetical protein  52.24 
 
 		 137 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1367  hypothetical protein  52.24 
 
 		 137 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1758  HK97 family phage protein  39.53 
 
 		 147 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.594497 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1326  HK97 family phage protein  37.2 
 
 		 160 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0053564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1888  HK97 family phage protein  37.5 
 
 		 138 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1977  hypothetical protein  37.34 
 
 		 153 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0997  HK97 family phage protein  33.52 
 
 		 152 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5448  hypothetical protein  42.64 
 
 		 136 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1887  hypothetical protein  40.32 
 
 		 139 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.526852  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5447  hypothetical protein  34.5 
 
 		 138 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0247  HK97 family phage protein  33.33 
 
 		 146 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1477  phage protein, HK97, gp10  35.71 
 
 		 141 aa  86.3  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1621  Phage protein, HK97, gp10  35.71 
 
 		 141 aa  86.3  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.421148  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4288  phage protein, HK97 gp10 family  35.4 
 
 		 165 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784721  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2607  phage protein, HK97 gp10 family  34.78 
 
 		 165 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151484  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1366  HK97 family phage protein  40.57 
 
 		 137 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0283  HK97 family phage protein  35.29 
 
 		 137 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3985  hypothetical protein  35.82 
 
 		 138 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7322  phage protein, HK97 gp10 family  33.33 
 
 		 184 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.43854  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2354  hypothetical protein  28.93 
 
 		 140 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2483  hypothetical protein  28.36 
 
 		 137 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0996  gene transfer agent  31.88 
 
 		 135 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.95396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3896  phage protein, HK97 gp10 family  33.09 
 
 		 161 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0197617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3938  HK97 family phage protein  26.35 
 
 		 166 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0369  hypothetical protein  42.11 
 
 		 96 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2003  phage protein, HK97 gp10 family  37.84 
 
 		 190 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.919171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>