18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1366 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1366  HK97 family phage protein  100 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0283  HK97 family phage protein  83.21 
 
 		 137 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1621  Phage protein, HK97, gp10  63.91 
 
 		 141 aa  172  9e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.421148  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1477  phage protein, HK97, gp10  63.91 
 
 		 141 aa  172  9e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1888  HK97 family phage protein  58.65 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5447  hypothetical protein  52.63 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2354  hypothetical protein  52.34 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0868  hypothetical protein  36.31 
 
 		 305 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0683632  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1326  HK97 family phage protein  31.29 
 
 		 160 aa  70.1  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0053564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1758  HK97 family phage protein  27.7 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.594497 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0247  HK97 family phage protein  28.28 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0997  HK97 family phage protein  27.56 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3990  phage protein, HK97 gp10 family  31.43 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4288  phage protein, HK97 gp10 family  31.51 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784721  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2607  phage protein, HK97 gp10 family  30.14 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151484  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1977  hypothetical protein  28.76 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2479  Phage protein, HK97, gp10  24.64 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2479  phage protein, HK97 gp10 family  38.71 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>