19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1477 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1621  Phage protein, HK97, gp10  100 
 
 		 141 aa  286  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.421148  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1477  phage protein, HK97, gp10  100 
 
 		 141 aa  286  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1888  HK97 family phage protein  64.18 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0283  HK97 family phage protein  64.44 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1366  HK97 family phage protein  63.91 
 
 		 137 aa  156  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5447  hypothetical protein  59.23 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2354  hypothetical protein  49.25 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0868  hypothetical protein  35.71 
 
 		 305 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0683632  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1326  HK97 family phage protein  33.33 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0053564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0247  HK97 family phage protein  29.8 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4288  phage protein, HK97 gp10 family  35.17 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784721  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2607  phage protein, HK97 gp10 family  34.48 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151484  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3990  phage protein, HK97 gp10 family  31.01 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1758  HK97 family phage protein  27.59 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.594497 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0997  HK97 family phage protein  28.1 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2479  Phage protein, HK97, gp10  25.9 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1977  hypothetical protein  28.19 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0631  phage protein, HK97 gp10 family  23.85 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6245  hypothetical protein  26.32 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000335649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>