23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2354 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2354  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  276  7e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1888  HK97 family phage protein  51.59 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1477  phage protein, HK97, gp10  49.25 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1621  Phage protein, HK97, gp10  49.25 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.421148  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1366  HK97 family phage protein  52.34 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0283  HK97 family phage protein  49.22 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5447  hypothetical protein  42.86 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6245  hypothetical protein  35.64 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000335649  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1758  HK97 family phage protein  35.96 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.594497 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1326  HK97 family phage protein  28.97 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0053564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0868  hypothetical protein  28.93 
 
 		 305 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0683632  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2607  phage protein, HK97 gp10 family  31.03 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151484  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1640  hypothetical protein  38.79 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4288  phage protein, HK97 gp10 family  31.03 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784721  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0247  HK97 family phage protein  30.71 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0997  HK97 family phage protein  26.8 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0639  HK97 family phage protein  32.87 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2958  hypothetical protein  33.55 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1768  hypothetical protein  28.04 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1977  hypothetical protein  26.53 
 
 		 153 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0631  phage protein, HK97 gp10 family  25.58 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1141  hypothetical protein  29.21 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2588  phage protein, HK97 gp10 family  43.48 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.741873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>