17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0997 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0997  HK97 family phage protein  100 
 
 		 152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1758  HK97 family phage protein  60.53 
 
 		 147 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.594497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1977  hypothetical protein  50.31 
 
 		 153 aa  140  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1326  HK97 family phage protein  44.64 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0053564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0868  hypothetical protein  33.52 
 
 		 305 aa  100  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0683632  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0247  HK97 family phage protein  36.49 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1888  HK97 family phage protein  32.19 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0369  hypothetical protein  37.76 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2607  phage protein, HK97 gp10 family  31.9 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0283  HK97 family phage protein  30.15 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1621  Phage protein, HK97, gp10  28.1 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.421148  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1477  phage protein, HK97, gp10  28.1 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5447  hypothetical protein  28.28 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4288  phage protein, HK97 gp10 family  29.7 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784721  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2354  hypothetical protein  26.8 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1366  HK97 family phage protein  27.07 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3871  HK97 family phage protein  33.33 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557276  normal  0.0333668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>