22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1888 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1888  HK97 family phage protein  100 
 
 		 138 aa  283  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5447  hypothetical protein  62.5 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1621  Phage protein, HK97, gp10  64.18 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.421148  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1477  phage protein, HK97, gp10  64.18 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0283  HK97 family phage protein  58.52 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1366  HK97 family phage protein  58.65 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2354  hypothetical protein  51.59 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0868  hypothetical protein  37.5 
 
 		 305 aa  104  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0683632  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1326  HK97 family phage protein  38.16 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0053564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1758  HK97 family phage protein  33.57 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.594497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2607  phage protein, HK97 gp10 family  36.3 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4288  phage protein, HK97 gp10 family  36.3 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784721  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0997  HK97 family phage protein  32.19 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0247  HK97 family phage protein  33.82 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1977  hypothetical protein  30.72 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6245  hypothetical protein  30.77 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000335649  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1141  hypothetical protein  31.15 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3990  phage protein, HK97 gp10 family  28.87 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1768  hypothetical protein  30.7 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2479  phage protein, HK97 gp10 family  47.62 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119601  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1224  hypothetical protein  25.47 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3490  HK97 family phage protein  33.33 
 
 		 115 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0844725  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>