19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5447 on replicon NC_010721
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010721  Mpop_5447  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1888  HK97 family phage protein  62.5 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1621  Phage protein, HK97, gp10  59.23 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.421148  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1477  phage protein, HK97, gp10  59.23 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0283  HK97 family phage protein  52.99 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1366  HK97 family phage protein  52.63 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2354  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0868  hypothetical protein  34.5 
 
 		 305 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0683632  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2607  phage protein, HK97 gp10 family  38.36 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4288  phage protein, HK97 gp10 family  38.62 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784721  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1326  HK97 family phage protein  30.92 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0053564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1758  HK97 family phage protein  30.2 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.594497 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0247  HK97 family phage protein  32.62 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3990  phage protein, HK97 gp10 family  32.06 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1977  hypothetical protein  29.41 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0997  HK97 family phage protein  28.28 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1141  hypothetical protein  26.45 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2479  Phage protein, HK97, gp10  29.1 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1768  hypothetical protein  27.2 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>