16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1977 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1977  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1758  HK97 family phage protein  54.43 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.594497 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0997  HK97 family phage protein  50.31 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1326  HK97 family phage protein  47.4 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0053564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0868  hypothetical protein  37.34 
 
 		 305 aa  103  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0683632  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4288  phage protein, HK97 gp10 family  39.47 
 
 		 165 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784721  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2607  phage protein, HK97 gp10 family  38.16 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151484  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0247  HK97 family phage protein  32.88 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1888  HK97 family phage protein  30.72 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0369  hypothetical protein  35.29 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5447  hypothetical protein  29.41 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1477  phage protein, HK97, gp10  28.19 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1621  Phage protein, HK97, gp10  28.19 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.421148  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1366  HK97 family phage protein  25.78 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2354  hypothetical protein  26.53 
 
 		 140 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0283  HK97 family phage protein  25.78 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>