14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2958 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2958  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  315  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2588  phage protein, HK97 gp10 family  91.45 
 
 		 154 aa  293  8e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.741873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4109  HK97 family phage protein  45.27 
 
 		 161 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1571  hypothetical protein  44.83 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88517  hitchhiker  0.0039923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1343  HK97 family phage protein  44.14 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.381849 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1684  HK97 family phage protein  29.33 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1051  HK97 family phage protein  29.33 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.325437  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3871  HK97 family phage protein  28 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557276  normal  0.0333668 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0458  hypothetical protein  26.62 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74928 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1640  hypothetical protein  29.41 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2354  hypothetical protein  33.55 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1193  HK97 family phage protein  27.69 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000986057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6245  hypothetical protein  27.78 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000335649  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3168  HK97 family phage protein  27.52 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00719804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>