15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1343 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1343  HK97 family phage protein  100 
 
 		 161 aa  326  8e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.381849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4109  HK97 family phage protein  88.82 
 
 		 161 aa  293  9e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1571  hypothetical protein  89.86 
 
 		 161 aa  273  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88517  hitchhiker  0.0039923 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2588  phage protein, HK97 gp10 family  42.48 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.741873 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2958  hypothetical protein  43.92 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1684  HK97 family phage protein  51.11 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1051  HK97 family phage protein  51.11 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.325437  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0458  hypothetical protein  25.17 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74928 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3871  HK97 family phage protein  44.44 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557276  normal  0.0333668 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2888  phage protein, HK97 gp10 family  28.48 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1544  phage protein, HK97 gp10 family  28.48 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0566453 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2178  phage protein, HK97 gp10 family  28.48 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248961 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2242  phage protein, HK97 gp10 family  28.48 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000544361 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0931  phage protein, HK97 gp10 family  27.81 
 
 		 148 aa  44.3  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2496  phage protein, HK97 gp10 family  37.25 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0313023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>