18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4109 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4109  HK97 family phage protein  100 
 
 		 161 aa  322  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1571  hypothetical protein  95.95 
 
 		 161 aa  290  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88517  hitchhiker  0.0039923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1343  HK97 family phage protein  89.19 
 
 		 161 aa  274  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.381849 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2958  hypothetical protein  45.27 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2588  phage protein, HK97 gp10 family  41.83 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.741873 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0458  hypothetical protein  25.85 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74928 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1051  HK97 family phage protein  51.11 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.325437  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1684  HK97 family phage protein  51.11 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3871  HK97 family phage protein  44.44 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557276  normal  0.0333668 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0931  phage protein, HK97 gp10 family  28.93 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2888  phage protein, HK97 gp10 family  29.75 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1544  phage protein, HK97 gp10 family  28.93 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0566453 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2178  phage protein, HK97 gp10 family  28.93 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248961 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2242  phage protein, HK97 gp10 family  28.93 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000544361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2627  phage protein, HK97 gp10 family  28.06 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1193  HK97 family phage protein  28.8 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000986057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2496  phage protein, HK97 gp10 family  37.25 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0313023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2232  HK97 family phage protein  25.66 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.912858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>