28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1684 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1684  HK97 family phage protein  100 
 
 
140 aa  279  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1051  HK97 family phage protein  91.43 
 
 
140 aa  260  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.325437  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3871  HK97 family phage protein  84.78 
 
 
140 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557276  normal  0.0333668 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1193  HK97 family phage protein  42.76 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000986057 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2888  phage protein, HK97 gp10 family  42.45 
 
 
148 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220856 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0931  phage protein, HK97 gp10 family  41.73 
 
 
148 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2242  phage protein, HK97 gp10 family  41.73 
 
 
148 aa  103  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000544361 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2178  phage protein, HK97 gp10 family  41.73 
 
 
148 aa  103  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248961 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1544  phage protein, HK97 gp10 family  41.73 
 
 
148 aa  103  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0566453 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2232  HK97 family phage protein  38.78 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.912858 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3168  HK97 family phage protein  33.78 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00719804 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0631  phage protein, HK97 gp10 family  33.58 
 
 
119 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2958  hypothetical protein  29.33 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2588  phage protein, HK97 gp10 family  28.28 
 
 
154 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.741873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4109  HK97 family phage protein  51.11 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0458  hypothetical protein  26.85 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.74928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2496  phage protein, HK97 gp10 family  51.06 
 
 
167 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0313023  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1343  HK97 family phage protein  52.38 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.381849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1571  hypothetical protein  52.38 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88517  hitchhiker  0.0039923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2479  phage protein, HK97 gp10 family  40.82 
 
 
179 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1638  HK97 family phage protein  32.14 
 
 
152 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.048503  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0654  Phage protein, HK97, gp10  36.84 
 
 
201 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3391  HK97 family phage protein  31.33 
 
 
169 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  hitchhiker  0.00000000275201 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1640  hypothetical protein  29.1 
 
 
157 aa  43.5  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3322  HK97 family phage protein  28.14 
 
 
186 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0654407 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1639  HK97 family phage protein  33.02 
 
 
146 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2590  HK97 family phage protein  36.63 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1462  phage protein, HK97 gp10 family  31.48 
 
 
118 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>