17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1640 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1640  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  310  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0639  HK97 family phage protein  60.56 
 
 		 154 aa  168  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3322  HK97 family phage protein  39.05 
 
 		 186 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0654407 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2065  hypothetical protein  37.06 
 
 		 185 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307033  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6245  hypothetical protein  38.81 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000335649  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6190  hypothetical protein  39.71 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608804  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1665  hypothetical protein  35.85 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1617  hypothetical protein  35.85 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.482564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2354  hypothetical protein  37.4 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2479  phage protein, HK97 gp10 family  26.44 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119601  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0458  hypothetical protein  30.72 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74928 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2958  hypothetical protein  29.41 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2588  phage protein, HK97 gp10 family  26.62 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.741873 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1051  HK97 family phage protein  31.25 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.325437  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1684  HK97 family phage protein  29.1 
 
 		 140 aa  43.9  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1193  HK97 family phage protein  28.57 
 
 		 148 aa  43.9  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000986057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4109  HK97 family phage protein  28.39 
 
 		 161 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>