21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3168 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3168  HK97 family phage protein  100 
 
 		 156 aa  306  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00719804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3871  HK97 family phage protein  36 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557276  normal  0.0333668 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1684  HK97 family phage protein  33.78 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1051  HK97 family phage protein  34.46 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.325437  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0458  hypothetical protein  34.72 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2888  phage protein, HK97 gp10 family  30.77 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2242  phage protein, HK97 gp10 family  30.77 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000544361 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2178  phage protein, HK97 gp10 family  30.77 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248961 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1544  phage protein, HK97 gp10 family  30.77 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0566453 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0931  phage protein, HK97 gp10 family  29.75 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2479  phage protein, HK97 gp10 family  50 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119601  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3391  HK97 family phage protein  32.67 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  hitchhiker  0.00000000275201 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1193  HK97 family phage protein  28.57 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000986057 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0631  phage protein, HK97 gp10 family  29.45 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2232  HK97 family phage protein  27.13 
 
 		 149 aa  43.9  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.912858 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4087  hypothetical protein  29.51 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3799  hypothetical protein  29.51 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2243  hypothetical protein  29.51 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00223388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2627  phage protein, HK97 gp10 family  46.51 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2958  hypothetical protein  27.52 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2496  phage protein, HK97 gp10 family  42.86 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0313023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>