22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2178 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2242  phage protein, HK97 gp10 family  100 
 
 
148 aa  300  5.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000544361 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2178  phage protein, HK97 gp10 family  100 
 
 
148 aa  300  5.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248961 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1544  phage protein, HK97 gp10 family  100 
 
 
148 aa  300  5.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0566453 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2888  phage protein, HK97 gp10 family  99.32 
 
 
148 aa  295  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220856 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0931  phage protein, HK97 gp10 family  97.3 
 
 
148 aa  291  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2232  HK97 family phage protein  69.13 
 
 
149 aa  214  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.912858 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1193  HK97 family phage protein  69.44 
 
 
148 aa  205  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000986057 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3871  HK97 family phage protein  43.17 
 
 
140 aa  110  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557276  normal  0.0333668 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1684  HK97 family phage protein  41.73 
 
 
140 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1051  HK97 family phage protein  41.73 
 
 
140 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.325437  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0631  phage protein, HK97 gp10 family  33.07 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3168  HK97 family phage protein  30.77 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00719804 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2496  phage protein, HK97 gp10 family  28.4 
 
 
167 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0313023  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3391  HK97 family phage protein  29.86 
 
 
169 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  hitchhiker  0.00000000275201 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2590  HK97 family phage protein  26.45 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4109  HK97 family phage protein  28.93 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1571  hypothetical protein  29.31 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88517  hitchhiker  0.0039923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2479  phage protein, HK97 gp10 family  29.25 
 
 
179 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1638  HK97 family phage protein  26.92 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.048503  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0458  hypothetical protein  37.78 
 
 
155 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.74928 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1343  HK97 family phage protein  28.08 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.381849 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1639  HK97 family phage protein  29.06 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>