20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5448 on replicon NC_010721
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010721  Mpop_5448  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  271  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1476  hypothetical protein  50.75 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1620  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.616649  normal  0.259458 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0284  hypothetical protein  45.59 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1367  hypothetical protein  44.85 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1887  hypothetical protein  45.04 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.526852  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0868  hypothetical protein  42.64 
 
 		 305 aa  92.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0683632  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3985  hypothetical protein  41.43 
 
 		 138 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2483  hypothetical protein  31.16 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1978  hypothetical protein  42.25 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1815  gene transfer agent (GTA) orfg8  32.12 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00634922  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1325  gene transfer agent  33.33 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00376041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1757  hypothetical protein  37.62 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2108  gene transfer agent (GTA) like protein  34.58 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354227  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6047  hypothetical protein  32.33 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0996  gene transfer agent  32.58 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.95396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1982  gene transfer agent (GTA) orfg8  33.33 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.504072 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0248  hypothetical protein  27.13 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3466  gene transfer agent (GTA) orfg8  32.11 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.018674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1173  gene transfer agent (GTA) like protein  29.55 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.777288  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>