19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5999 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5999  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  361  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0853  hypothetical protein  48.37 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1028  hypothetical protein  57.05 
 
 		 186 aa  148  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.241643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1153  hypothetical protein  45.6 
 
 		 190 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0255  hypothetical protein  50 
 
 		 192 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0250  hypothetical protein  50 
 
 		 192 aa  135  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2088  hypothetical protein  43 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.374486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0313  hypothetical protein  48.5 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0370  hypothetical protein  43.32 
 
 		 195 aa  133  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1997  hypothetical protein  52.07 
 
 		 143 aa  111  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0312048  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0071  hypothetical protein  36.36 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5007  hypothetical protein  37.02 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3504  hypothetical protein  36.61 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00345885  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1770  hypothetical protein  52.17 
 
 		 138 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0625368  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3709  conserved hypothetical periplasmic protein  38.56 
 
 		 204 aa  88.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3386  hypothetical protein  38.67 
 
 		 204 aa  88.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1197  hypothetical protein  43.97 
 
 		 159 aa  85.1  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2257  hypothetical protein  46.59 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00629752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1998  hypothetical protein  32.08 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>