19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1028 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1028  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  360  9e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.241643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5999  hypothetical protein  51.89 
 
 		 183 aa  174  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1153  hypothetical protein  50.26 
 
 		 190 aa  164  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0255  hypothetical protein  55.23 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0250  hypothetical protein  54.65 
 
 		 192 aa  157  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0313  hypothetical protein  53.49 
 
 		 192 aa  157  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0853  hypothetical protein  47.64 
 
 		 189 aa  154  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2088  hypothetical protein  46.57 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.374486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0370  hypothetical protein  46.23 
 
 		 195 aa  140  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3504  hypothetical protein  42.93 
 
 		 192 aa  121  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00345885  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5007  hypothetical protein  43.72 
 
 		 191 aa  117  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0071  hypothetical protein  42.72 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1997  hypothetical protein  50.72 
 
 		 143 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0312048  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1770  hypothetical protein  50.72 
 
 		 138 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0625368  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3709  conserved hypothetical periplasmic protein  37.25 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3386  hypothetical protein  40.88 
 
 		 204 aa  98.6  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1197  hypothetical protein  46.15 
 
 		 159 aa  94.4  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2257  hypothetical protein  47.92 
 
 		 134 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00629752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1998  hypothetical protein  35.34 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>