19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5007 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5007  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3504  hypothetical protein  70.68 
 
 		 192 aa  268  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00345885  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3709  conserved hypothetical periplasmic protein  51.47 
 
 		 204 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3386  hypothetical protein  50.24 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0370  hypothetical protein  45.7 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0255  hypothetical protein  43.96 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0853  hypothetical protein  42.19 
 
 		 189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0313  hypothetical protein  43.93 
 
 		 192 aa  117  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1153  hypothetical protein  41.21 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0250  hypothetical protein  43.41 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5999  hypothetical protein  37.02 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1028  hypothetical protein  45.4 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.241643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2088  hypothetical protein  34.95 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.374486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1770  hypothetical protein  42.86 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0625368  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0071  hypothetical protein  35.24 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1997  hypothetical protein  39.69 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0312048  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1197  hypothetical protein  31.09 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2257  hypothetical protein  36.46 
 
 		 134 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00629752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1998  hypothetical protein  27.93 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>