19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2088 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2088  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.374486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1153  hypothetical protein  48.24 
 
 		 190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0071  hypothetical protein  50.98 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0853  hypothetical protein  48.17 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0313  hypothetical protein  49.73 
 
 		 192 aa  157  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0255  hypothetical protein  51.35 
 
 		 192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0250  hypothetical protein  52.78 
 
 		 192 aa  154  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0370  hypothetical protein  45.54 
 
 		 195 aa  148  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5999  hypothetical protein  44 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1028  hypothetical protein  51.93 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.241643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1197  hypothetical protein  49.18 
 
 		 159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1770  hypothetical protein  48.51 
 
 		 138 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0625368  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3386  hypothetical protein  42.05 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3709  conserved hypothetical periplasmic protein  39.61 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3504  hypothetical protein  36.76 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00345885  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5007  hypothetical protein  37.86 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1997  hypothetical protein  54.21 
 
 		 143 aa  98.6  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0312048  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2257  hypothetical protein  39.09 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00629752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1998  hypothetical protein  35.51 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>