19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1770 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1770  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  263  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0625368  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1997  hypothetical protein  64.58 
 
 		 143 aa  156  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0312048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1153  hypothetical protein  55.3 
 
 		 190 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0853  hypothetical protein  54.55 
 
 		 189 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0255  hypothetical protein  68.63 
 
 		 192 aa  127  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0250  hypothetical protein  67.65 
 
 		 192 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0313  hypothetical protein  61.61 
 
 		 192 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0370  hypothetical protein  56.25 
 
 		 195 aa  113  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5999  hypothetical protein  52.17 
 
 		 183 aa  100  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1998  hypothetical protein  46.6 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2088  hypothetical protein  48.51 
 
 		 203 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.374486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1197  hypothetical protein  44.35 
 
 		 159 aa  94.4  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1028  hypothetical protein  53.04 
 
 		 186 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.241643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0071  hypothetical protein  39.82 
 
 		 215 aa  84.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5007  hypothetical protein  42.86 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3709  conserved hypothetical periplasmic protein  41.43 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3386  hypothetical protein  42.61 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3504  hypothetical protein  41.18 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00345885  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2257  hypothetical protein  38.64 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00629752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>