19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0853 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0853  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  364  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1153  hypothetical protein  75.66 
 
 
190 aa  275  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0313  hypothetical protein  64.94 
 
 
192 aa  194  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0255  hypothetical protein  62.07 
 
 
192 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0250  hypothetical protein  61.49 
 
 
192 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0370  hypothetical protein  57.84 
 
 
195 aa  171  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5999  hypothetical protein  48.37 
 
 
183 aa  151  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2088  hypothetical protein  46.07 
 
 
203 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.374486  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1028  hypothetical protein  52.1 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.241643  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1770  hypothetical protein  54.55 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0625368  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1997  hypothetical protein  50.71 
 
 
143 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0312048  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0071  hypothetical protein  41.87 
 
 
215 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5007  hypothetical protein  42.19 
 
 
191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3504  hypothetical protein  46.11 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00345885  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3709  conserved hypothetical periplasmic protein  39.7 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3386  hypothetical protein  43.75 
 
 
204 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1197  hypothetical protein  51.69 
 
 
159 aa  93.6  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2257  hypothetical protein  46.67 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00629752  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1998  hypothetical protein  32.08 
 
 
144 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>