19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3386 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3386  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3709  conserved hypothetical periplasmic protein  95.1 
 
 		 204 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3504  hypothetical protein  54.46 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00345885  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5007  hypothetical protein  52.55 
 
 		 191 aa  174  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0370  hypothetical protein  47.46 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0313  hypothetical protein  47.62 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0853  hypothetical protein  43.75 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1153  hypothetical protein  37.69 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0255  hypothetical protein  48.73 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0250  hypothetical protein  48.39 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2088  hypothetical protein  39.6 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.374486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5999  hypothetical protein  39.61 
 
 		 183 aa  89  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1028  hypothetical protein  40.88 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.241643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1997  hypothetical protein  39.31 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0312048  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1770  hypothetical protein  42.61 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0625368  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0071  hypothetical protein  32.61 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2257  hypothetical protein  41.05 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00629752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1197  hypothetical protein  38.89 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1998  hypothetical protein  26.77 
 
 		 144 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>