19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0370 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0370  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0313  hypothetical protein  66.29 
 
 
192 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1153  hypothetical protein  60 
 
 
190 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0255  hypothetical protein  67.43 
 
 
192 aa  201  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0250  hypothetical protein  66.86 
 
 
192 aa  198  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0853  hypothetical protein  58.38 
 
 
189 aa  191  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2088  hypothetical protein  42.93 
 
 
203 aa  143  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.374486  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5999  hypothetical protein  43.32 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5007  hypothetical protein  45.7 
 
 
191 aa  137  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3504  hypothetical protein  45.7 
 
 
192 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00345885  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3386  hypothetical protein  48.52 
 
 
204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3709  conserved hypothetical periplasmic protein  47.88 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1028  hypothetical protein  44.22 
 
 
186 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.241643  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1770  hypothetical protein  56.64 
 
 
138 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0625368  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0071  hypothetical protein  39.34 
 
 
215 aa  108  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1997  hypothetical protein  59.57 
 
 
143 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0312048  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1197  hypothetical protein  47.37 
 
 
159 aa  99.8  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2257  hypothetical protein  45.28 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00629752  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1998  hypothetical protein  36.26 
 
 
144 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>