18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1998 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1998  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  288  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1997  hypothetical protein  43.26 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0312048  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1770  hypothetical protein  46.6 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0625368  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0255  hypothetical protein  45.05 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0250  hypothetical protein  45.05 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0313  hypothetical protein  43.69 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1153  hypothetical protein  33.98 
 
 		 190 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5999  hypothetical protein  32.08 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0370  hypothetical protein  36.26 
 
 		 195 aa  63.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0853  hypothetical protein  32.08 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0071  hypothetical protein  34.83 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1197  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1028  hypothetical protein  35.92 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.241643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2088  hypothetical protein  34.78 
 
 		 203 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.374486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3709  conserved hypothetical periplasmic protein  27.27 
 
 		 204 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3504  hypothetical protein  26.62 
 
 		 192 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00345885  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3386  hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5007  hypothetical protein  28.32 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.908987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>