19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0250 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0250  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  370  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0255  hypothetical protein  98.96 
 
 		 192 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0313  hypothetical protein  77.6 
 
 		 192 aa  261  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0370  hypothetical protein  65.43 
 
 		 195 aa  200  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1153  hypothetical protein  58.12 
 
 		 190 aa  198  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0853  hypothetical protein  58.33 
 
 		 189 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2088  hypothetical protein  53.65 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.374486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5999  hypothetical protein  47.62 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1028  hypothetical protein  54.65 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.241643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1770  hypothetical protein  64.71 
 
 		 138 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0625368  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3504  hypothetical protein  45.03 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00345885  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5007  hypothetical protein  42.86 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0071  hypothetical protein  39.3 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3709  conserved hypothetical periplasmic protein  48.73 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1997  hypothetical protein  52.17 
 
 		 143 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0312048  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3386  hypothetical protein  48.1 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1197  hypothetical protein  46.61 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1998  hypothetical protein  45.05 
 
 		 144 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2257  hypothetical protein  41.09 
 
 		 134 aa  67  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00629752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>