18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2257 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2257  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  261  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00629752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1028  hypothetical protein  47.92 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.241643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1153  hypothetical protein  51.02 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0853  hypothetical protein  46.67 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0313  hypothetical protein  45.45 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5999  hypothetical protein  46.59 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0370  hypothetical protein  44.34 
 
 		 195 aa  70.5  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2088  hypothetical protein  39.09 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.374486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3386  hypothetical protein  41.05 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3709  conserved hypothetical periplasmic protein  35.21 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0255  hypothetical protein  43.69 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0250  hypothetical protein  44.9 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1197  hypothetical protein  33.85 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3504  hypothetical protein  43.16 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00345885  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5007  hypothetical protein  36.46 
 
 		 191 aa  53.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1770  hypothetical protein  38.64 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0625368  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0071  hypothetical protein  33.06 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1997  hypothetical protein  36.56 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0312048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>