19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0313 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0313  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  371  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0255  hypothetical protein  78.12 
 
 
192 aa  248  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0250  hypothetical protein  77.6 
 
 
192 aa  246  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1153  hypothetical protein  62.11 
 
 
190 aa  206  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0370  hypothetical protein  64.36 
 
 
195 aa  202  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0853  hypothetical protein  61.58 
 
 
189 aa  202  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2088  hypothetical protein  49.24 
 
 
203 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.374486  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1028  hypothetical protein  53.18 
 
 
186 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.241643  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1770  hypothetical protein  58.91 
 
 
138 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0625368  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5999  hypothetical protein  45.11 
 
 
183 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3504  hypothetical protein  45.95 
 
 
192 aa  128  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00345885  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5007  hypothetical protein  43.55 
 
 
191 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1997  hypothetical protein  66.99 
 
 
143 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0312048  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0071  hypothetical protein  39.5 
 
 
215 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3709  conserved hypothetical periplasmic protein  47.65 
 
 
204 aa  111  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3386  hypothetical protein  47.33 
 
 
204 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1197  hypothetical protein  43.48 
 
 
159 aa  96.3  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1998  hypothetical protein  43.69 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2257  hypothetical protein  45.45 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00629752  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>