34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4245 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4245  addiction module antidote  100 
 
 		 75 aa  154  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8344  addiction module antidote  65.33 
 
 		 74 aa  100  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0218  putative addiction module antidote  65.33 
 
 		 74 aa  100  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1578  addiction module antidote  66.67 
 
 		 74 aa  99.4  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23904 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3405  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  61.33 
 
 		 74 aa  97.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1983  addiction module antidote  52 
 
 		 74 aa  87  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4393  addiction module antidote  54.67 
 
 		 75 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2222  putative addiction module antidote  52 
 
 		 74 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.286313  hitchhiker  0.00864042 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2110  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  57.14 
 
 		 73 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2467  SpoVT/AbrB domain-containing protein  50.67 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0034  hypothetical protein  53.33 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6861  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  50 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387116  normal  0.292975 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2175  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  55.71 
 
 		 73 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.634416  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0781  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  54.29 
 
 		 73 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1371  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  55.71 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4595  addiction module antidote  52.78 
 
 		 73 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00566686  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1314  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  52.86 
 
 		 73 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271247  normal  0.35065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  44.44 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157013  normal  0.120349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1432  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.06 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1412  SpoVT/AbrB-like  44.59 
 
 		 86 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2982  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.83 
 
 		 74 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02087  putative addiction module antidote  45.83 
 
 		 73 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00220  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0853  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  42.65 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3137  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.11 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.11 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1258  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  44.29 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2705  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  46.58 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4109  SpoVT/AbrB-like  33.33 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.462334  normal  0.998914 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4123  hypothetical protein  30 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2153  SpoVT/AbrB domain protein  34.67 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.84509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3452  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  31.43 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4296  hypothetical protein  28.57 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2955  hypothetical protein  30.36 
 
 		 68 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>