27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4109 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4109  SpoVT/AbrB-like  100 
 
 
75 aa  148  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.462334  normal  0.998914 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8344  addiction module antidote  45.83 
 
 
74 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1578  addiction module antidote  43.06 
 
 
74 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23904 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0034  hypothetical protein  46.58 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02087  putative addiction module antidote  39.44 
 
 
73 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4595  addiction module antidote  39.44 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00566686  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0218  putative addiction module antidote  39.44 
 
 
74 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2467  SpoVT/AbrB domain-containing protein  33.8 
 
 
74 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3405  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.49 
 
 
74 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2982  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.06 
 
 
74 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1983  addiction module antidote  33.8 
 
 
74 aa  53.9  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4393  addiction module antidote  36.99 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4245  addiction module antidote  33.33 
 
 
75 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2222  putative addiction module antidote  33.8 
 
 
74 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.286313  hitchhiker  0.00864042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0853  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.11 
 
 
73 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1412  SpoVT/AbrB-like  36 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288311  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1314  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.33 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271247  normal  0.35065 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2110  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.78 
 
 
73 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00220  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.8 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2705  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.33 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6861  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.33 
 
 
74 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387116  normal  0.292975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1432  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  27.63 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0781  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  30.43 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1371  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.78 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2175  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.78 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.634416  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  28.77 
 
 
74 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157013  normal  0.120349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1258  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  30.56 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.277274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>