36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1578 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1578  addiction module antidote  100 
 
 		 74 aa  151  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23904 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8344  addiction module antidote  72.97 
 
 		 74 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3405  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  68.92 
 
 		 74 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0218  putative addiction module antidote  67.57 
 
 		 74 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2467  SpoVT/AbrB domain-containing protein  63.51 
 
 		 74 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2222  putative addiction module antidote  63.51 
 
 		 74 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.286313  hitchhiker  0.00864042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4245  addiction module antidote  66.67 
 
 		 75 aa  99.4  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1983  addiction module antidote  58.11 
 
 		 74 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02087  putative addiction module antidote  57.75 
 
 		 73 aa  90.1  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4393  addiction module antidote  58.67 
 
 		 75 aa  89.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1314  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  59.42 
 
 		 73 aa  88.2  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271247  normal  0.35065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1371  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  57.97 
 
 		 73 aa  85.5  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2110  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  57.97 
 
 		 73 aa  85.9  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2175  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  57.97 
 
 		 73 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.634416  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0781  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  55.07 
 
 		 73 aa  84.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4595  addiction module antidote  53.52 
 
 		 73 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00566686  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0034  hypothetical protein  57.33 
 
 		 75 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2982  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  54.17 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1412  SpoVT/AbrB-like  53.42 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6861  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  51.39 
 
 		 74 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387116  normal  0.292975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4109  SpoVT/AbrB-like  43.06 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.462334  normal  0.998914 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0853  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  47.83 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.03 
 
 		 73 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3137  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.03 
 
 		 73 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408099 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2705  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  48.61 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00220  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.14 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2153  SpoVT/AbrB domain protein  41.89 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.84509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1258  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  44.93 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1432  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.28 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4123  hypothetical protein  39.19 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.28 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157013  normal  0.120349 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4296  hypothetical protein  36.49 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0558  AbrB family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0559  AbrB family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3452  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.43 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2185  hypothetical protein  36.67 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.753765  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>