35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3972 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 		 74 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157013  normal  0.120349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1432  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  97.3 
 
 		 91 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2982  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  52.7 
 
 		 74 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1412  SpoVT/AbrB-like  52.78 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6861  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  50 
 
 		 74 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387116  normal  0.292975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4245  addiction module antidote  44.44 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0781  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  47.3 
 
 		 73 aa  72  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00220  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.67 
 
 		 74 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2110  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.24 
 
 		 73 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4393  addiction module antidote  37.84 
 
 		 75 aa  67  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0034  hypothetical protein  40.54 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4595  addiction module antidote  41.89 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00566686  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1314  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.19 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271247  normal  0.35065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0218  putative addiction module antidote  44.44 
 
 		 74 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108167 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0853  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.95 
 
 		 73 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2175  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.89 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.634416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1371  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.89 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3405  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.06 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1258  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.24 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1983  addiction module antidote  36.49 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8344  addiction module antidote  39.19 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1578  addiction module antidote  40.28 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23904 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02087  putative addiction module antidote  39.19 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2222  putative addiction module antidote  37.5 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.286313  hitchhiker  0.00864042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2467  SpoVT/AbrB domain-containing protein  33.33 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.78 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3137  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.78 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408099 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2705  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.84 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4296  hypothetical protein  35.71 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4123  hypothetical protein  34.29 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2153  SpoVT/AbrB domain protein  37.5 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.84509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4109  SpoVT/AbrB-like  28.77 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.462334  normal  0.998914 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3452  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.88 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117604  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0558  AbrB family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0559  AbrB family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>