31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2222 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2222  putative addiction module antidote  100 
 
 		 74 aa  152  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.286313  hitchhiker  0.00864042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2467  SpoVT/AbrB domain-containing protein  83.78 
 
 		 74 aa  135  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1578  addiction module antidote  63.51 
 
 		 74 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23904 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8344  addiction module antidote  63.51 
 
 		 74 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3405  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  56.76 
 
 		 74 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0218  putative addiction module antidote  55.41 
 
 		 74 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108167 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2175  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  55.07 
 
 		 73 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.634416  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4393  addiction module antidote  57.33 
 
 		 75 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1314  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  53.62 
 
 		 73 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271247  normal  0.35065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4245  addiction module antidote  52 
 
 		 75 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1371  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  55.07 
 
 		 73 aa  84.3  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2110  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  52.17 
 
 		 73 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1983  addiction module antidote  47.89 
 
 		 74 aa  82.8  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0781  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  49.28 
 
 		 73 aa  82  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02087  putative addiction module antidote  50.7 
 
 		 73 aa  79  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4595  addiction module antidote  47.89 
 
 		 73 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00566686  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0034  hypothetical protein  50.67 
 
 		 75 aa  73.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1412  SpoVT/AbrB-like  45.83 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6861  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  42.47 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387116  normal  0.292975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2982  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.28 
 
 		 74 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00220  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.49 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  29.58 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3137  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  29.58 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408099 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.5 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157013  normal  0.120349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1432  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.5 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1258  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.13 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4109  SpoVT/AbrB-like  33.8 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.462334  normal  0.998914 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2153  SpoVT/AbrB domain protein  37.84 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.84509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0853  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.78 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2705  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.11 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2185  hypothetical protein  38.6 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.753765  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>